El 15 de Septiembre de 1821 se declaró la Independencia de España, noticia que llegó a Costa Rica el 13 de Octubre de ese año, instalándose la primera Junta de Gobierno en Noviembre. En Diciembre de ese año se firmó la primera Constitución, y en 1824 Costa Rica se convirtió en un Estado, en ese momento parte de las Provincias Unidas de América Central.
Después de la Declaración de Independencia, las cuatro principales ciudades del país: Cartago, Heredia, San José y Alajuela, también se sintieron autónomas entre sí, y tuvieron desacuerdos en varios puntos. Los líderes conservadores de Cartago y Heredia estaban a favor de unirse a México, mientras que los líderes republicanos de San José y Alajuela no estaban de acuerdo con esa posición. Después de una pequeña batalla en el Alto de Ochomogo en Cartago, los republicanos resultaron victoriosos y la anexión con México fue rechazada.
El 25 de Julio de 1824 el Partido de Nicoya (correspondiente a la mayoría de lo que hoy es Guanacaste) decidió unirse a Costa Rica.