Para 1848 la actividad económica de Costa Rica estaba centrada en la agricultura con el café siendo su principal producto de exportación. En ese año, la República de Costa Rica fue declarada por el Dr. José María Castro Madriz, dando vía a la formación de un fuerte gobierno central con una nueva división administrativa (Provincias, Cantones y Distritos).
En 1856 el país tuvo que enfrentar la amenaza de un grupo de filibusteros liderados por William Walker quienes trataron de ocupar el país. Los invasores fueron primero derrotados en Marzo en la Batalla de Santa Rosa (en Guanacaste) y una mayor victoria se obtuvo en la Batalla de Rivas (Nicaragua) el 11 de Abril, donde Juan Santamaría (el Héroe Nacional) murió mientras quemaba un edificio en el cual se encontraba estacionado el enemigo.